Number Footnote by Verse

After the clarification of the question, I changed substantially the example to adapt better to the desired layout, but the core of the answer is still that you can use \footnotetext[<mark>]{<text>} to make a footnote without marks in main text:

However, the \piedenota{} macro defined below write automatically the \versiculo reference, so just use it like a simple \footnote{} without optional argument, and you will be free of human mistakes messing with optional arguments.

The rest of the example below are only convenience macros to avoid typing or mimic a bit the main text structure, although without paying attention to headers margins, etc. Some notes about this off-topic part:

1. I do not see some like a table of contents (ToC) in a Spanish bible from 1975 so I defined \libro, \capitulo, \titulo in a quick and dirty way. If you will need a ToC or often cross-references to section levels it could be definitively better work with standard sectioning levels (\part, \chapter and \section) and redefine them conveniently. There are many questions about in this site.

2. For the verses (note: in Spanish "versículo", not "verso" like in poems) you can also consider a enumerate list with the enumitem package instead of a custom macro (some like \begin{enumerate}[wide, label=\textbf{\arabic*}., labelwidth=!, labelindent=\parindent] \item ... \item ... \end{enumerate} should work for this format) and then use cross-references for the footnote marks.

3. Sorry, the verses are pasted from elsewhere and they are quite different to text of the image, and notes are dummy text, but without a minimal working example (MWE) to start to play is a bit annoying write a whole bible page.

MWE:

\documentclass[twocolumn]{book}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[spanish]{babel}
\usepackage{xspace}
\usepackage{lipsum}
\usepackage{cuted}
\newcounter{versiculo}
\def\libro#1{\addtocounter{part}{1}
\begin{strip}
\centering\textbf{\Large\Roman{part}. \uppercase{#1}}
\end{strip}} 
\def\capitulo{\finversiculo{\addtocounter{chapter}{1}\centering\large
CAPÍTULO \Roman{chapter}\par\medskip}}
\def\titulo#1{{\par{\centering\bfseries #1 \par\medskip}}}
\def\versiculo{\par\addtocounter{versiculo}{1}%
\textbf{\arabic{versiculo}}.~}
\def\piedenota#1{\footnotetext[\value{versiculo}]{#1}}
\def\finversiculo{\setcounter{versiculo}{0}}
\makeatletter
\def\@makefnmark{\textbf{v.~\@thefnmark.}~}
\def\@makefntext#1{\parindent1em \@makefnmark #1}

\begin{document}

\libro{Cristo en su vida se muestra dios} 
\capitulo 
\titulo{Cristo, Verbo Eterno de Dios.}

\versiculo  
\piedenota{\textbf{En el principio:} Desde la eternidad. \lipsum*[2]}  
En el principio era el Verbo, y el Verbo era con Dios,
y el Verbo era Dios. 
\versiculo 
\piedenota{\textbf{Estaba\ldots en Dios.} como hijo suyo
coeterno y cosustancial.} 
\versiculo Todas las cosas por él fueron hechas, y sin él nada de lo
que ha sido hecho, fue hecho. 
\versiculo  En él estaba la vida, y la vida era la luz de los hombres. 
\versiculo  La luz en las tinieblas resplandece, y las tinieblas no
prevalecieron contra ella. 
\versiculo  Hubo un hombre enviado de Dios, el cual se llamaba Juan.
\versiculo Este vino por testimonio, para que diese testimonio de la
luz, a fin de que todos creyesen por él. 
\versiculo No era él la luz, sino para que diese testimonio de la luz. 
\versiculo Aquella luz verdadera, que alumbra a todo hombre,
venía a este mundo. 
\versiculo En el mundo estaba, y el mundo por él fue hecho;
pero el mundo no le conoció. 
\versiculo
\piedenota{\textbf{A su propia casa.} etc. }
A lo suyo vino, y los suyos no le recibieron. 
\versiculo Mas a todos los que le recibieron, a los que creen en su
nombre, les dio potestad de ser hechos hijos de Dios. 
\versiculo los cuales no son engendrados de sangre,
ni de voluntad de carne, ni de voluntad de varón, sino de Dios. 
\versiculo Y aquel Verbo fue hecho carne, y habitó entre nosotros
(y vimos su gloria, gloria como del unigénito del Padre),
lleno de gracia y de verdad. 

\titulo{\hfil Testimonios del Bautista}

\versiculo Juan dio testimonio de él, y clamó diciendo: Este es de
quien yo decía: El que viene después de mí, es antes de mí;
porque era primero que yo. 
\versiculo Porque de su plenitud tomamos todos, y gracia sobre gracia. 
\versiculo Pues la ley por medio de Moisés fue dada, pero la gracia y
la verdad vinieron por medio de Jesucristo. 
\versiculo A Dios nadie le vio jamás; el unigénito Hijo, que está en el
seno del Padre, él le ha dado a conocer. 


\hfil\vdots\par\bigskip %  ... rest of chapter 

\capitulo

\titulo{Las bodas de Caná} 

\versiculo Al tercer día se hicieron unas bodas en Caná de Galilea;
y estaba allí la madre de Jesús. 
\versiculo \piedenota{foo bar baz ...}
Y fueron también invitados a las bodas Jesús y sus discípulos. 
\versiculo Y faltando el vino, la madre de Jesús le dijo:
No tienen vino. 

\end{document}